本書講述了以小五郎的少年助手小林為團長的少年偵探團團員中先是相川泰二被人催眠回來偷走了父親的機密文件，此后又有幾名團員相繼失蹤等許多怪事，小五郎為此展開了艱難而危險的調查的故事。